JR西日本とJR九州はこのほど、山陽・九州新幹線直通列車「みずほ」「さくら」の特急料金を国土交通相に認可申請したと発表した。山陽・九州新幹線「さくら」は、普通指定席で新大阪〜熊本は1万8020円、同〜鹿児島中央は2万1300円。最速タイプの「みずほ」は山陽新幹線区間では「のぞみ」の特急料金となるため、300円程度上乗せになる。博多〜鹿児島中央は、運賃と特急料金を合わせて1万170円（普通車指定席）。運賃は年内にも認可される見通し。
みずほ、さくらの特急料金とグリーン料金は、原則として、現行の山陽新幹線の特急料金およびグリーン料金と、JR九州が申請した特急料金およびグリーン料金を合算したもの。東海道・山陽新幹線の、のぞみ、ひかりなどと九州新幹線つばめなどを博多駅で乗り継ぐ場合も合算となる。
博多〜鹿児島の利用料金は、特急「リレーつばめ」と九州新幹線「つばめ」を乗り継ぐ現行のルートより750円高くなる。
